Sebastian Kerk urodził się w 1994 roku w miejscowości Bad Wurzach i to właśnie w lokalnym klubie TSG zaczął swoją przygodę z futbolem. Jeszcze jako junior trafił jednak do drużyny SC Freiburg, gdzie z czasem zadebiutował w Bundeslidze. W kolejnych latach pomocnik był dwukrotnie wypożyczany do 2. Bundesligi - najpierw do 1. FC Nürnberg, a następnie do 1. FC Kaiserslautern. Ostatecznie, latem 2017 roku, przeniósł się na stałe do tego pierwszego zespołu.

W 2020 roku Niemiec został graczem VfL Osnabrück, ale później ponownie zmienił barwy klubowe i związał się z Hannoverem 96. Pierwszy sezon był w jego wykonaniu udany, drugi zdecydowanie mniej. Łącznie Kerk zgromadził 202 mecze na poziomie 1. i 2. Bundesligi, był też młodzieżowym reprezentantem swojego kraju.

Do Widzewa ofensywny pomocnik trafił w sierpniu 2023 roku. Zadebiutował w ligowym starciu z Cracovią, a niedługo później, w pucharowej potyczce z Concordią Elbląg, zdobył swoją pierwszą bramkę. Na początku października doznał niestety kontuzji, przez którą stracił resztę rundy jesiennej.

Kerk stopniowo wracał do pełnej dyspozycji, a w sezonie 2024/25 stał się podstawowym graczem Widzewa.