Mikołaj Kopko trafił do Akademii Widzewa latem 2024 roku ze Stomilu Olsztyn. W swoim pierwszym sezonie w czerwono-biało-czerwonych barwach reprezentował głównie drużynę U-17, której pomógł utrzymać się w Centralnej Lidze Juniorów. Zadebiutował także w czwartoligowych wówczas rezerwach.

Urodzony w 2008 roku gracz w obecnym sezonie pojawiał się zarówno w drużynie juniorów starszych, jak i w rezerwach, w których zaliczył dwa występy w Betclic 3. Lidze i trzy w okręgowym pucharze. W ostatnim czasie prawy obrońca był zapraszany na treningi pierwszego zespołu, a w zeszły weekend wziął też udział w grze wewnętrznej.

Mikołaj Kopko podpisał z Klubem kontrakt do czerwca 2027 roku z opcją przedłużenia.